MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120gamma

Total Repeats: 367

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003267	TCT	2	6	19	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_003267	TTAG	2	8	85	92	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003267	AGTTA	2	10	123	132	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003267	A	7	7	154	160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003267	TGA	2	6	308	313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003267	AGTA	2	8	385	392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003267	TCA	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_003267	T	6	6	421	426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003267	AGAT	2	8	432	439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003267	TAT	2	6	512	517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003267	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003267	TTTA	2	8	2845	2852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003267	CT	3	6	2931	2936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_003267	ATT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003267	ATC	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_003267	TGC	3	9	3387	3395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_003267	TAG	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003267	ACC	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_003267	TAAA	2	8	3549	3556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003267	ACA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_003267	CAAAA	2	10	4261	4270	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_003267	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_003267	A	6	6	6499	6504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003267	CT	3	6	7885	7890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_003267	AGT	2	6	8013	8018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003267	CAA	2	6	8019	8024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_003267	ATCC	2	8	8048	8055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_003267	CAA	2	6	8102	8107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_003267	AATC	2	8	8152	8159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_003267	ATA	2	6	9422	9427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003267	AGC	2	6	9481	9486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_003267	ATT	2	6	9507	9512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003267	AAT	2	6	9530	9535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003267	CAC	2	6	10047	10052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_003267	ATTC	2	8	10066	10073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_003267	CGATG	2	10	10076	10085	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_003267	TTC	2	6	10169	10174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_003267	AAG	2	6	10194	10199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003267	AGC	2	6	10220	10225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_003267	GAT	2	6	10312	10317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003267	A	6	6	10347	10352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003267	T	6	6	12925	12930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003267	ACTA	2	8	12936	12943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_003267	ATA	2	6	12955	12960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003267	T	6	6	15035	15040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003267	ATT	2	6	15440	15445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003267	T	6	6	15576	15581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003267	TAA	2	6	15603	15608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003267	TGC	3	9	15666	15674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_003267	CTGG	2	8	15686	15693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003267	AAT	2	6	15715	15720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003267	ATA	2	6	15741	15746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003267	CTG	2	6	15756	15761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_003267	ATCT	2	8	15770	15777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003267	TGAC	2	8	15801	15808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003267	AATAT	2	10	15837	15846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003267	GCT	2	6	15869	15874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_003267	CAT	2	6	16111	16116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_003267	ATC	2	6	16152	16157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_003267	G	6	6	17582	17587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003267	TAA	2	6	17616	17621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003267	ATAA	2	8	17623	17630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003267	TA	3	6	17758	17763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003267	CTGAA	2	10	17821	17830	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_003267	AAGC	2	8	17838	17845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_003267	ACT	2	6	17894	17899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_003267	GCT	2	6	17912	17917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_003267	CGG	2	6	17947	17952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003267	ATTCA	2	10	20348	20357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_003267	ACT	2	6	20363	20368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_003267	ATC	2	6	20370	20375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_003267	TAA	2	6	20526	20531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003267	T	6	6	20538	20543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003267	TGA	2	6	20608	20613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003267	GTA	2	6	20637	20642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003267	AAT	2	6	20664	20669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003267	AATAA	2	10	20674	20683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003267	T	6	6	20706	20711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003267	ATT	2	6	20756	20761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003267	GCTTT	2	10	20780	20789	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003267	C	6	6	20791	20796	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_003267	A	6	6	20994	20999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003267	TTA	2	6	21257	21262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003267	GCA	2	6	21340	21345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_003267	TGA	3	9	21395	21403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003267	T	6	6	21486	21491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003267	AG	3	6	21531	21536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003267	GTA	2	6	21611	21616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003267	CTG	2	6	21631	21636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_003267	AGGA	2	8	21693	21700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003267	TGC	2	6	22420	22425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_003267	TTTA	2	8	22435	22442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003267	TTG	2	6	22461	22466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003267	TTG	2	6	22495	22500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003267	T	6	6	22558	22563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003267	TCT	2	6	22575	22580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_003267	A	6	6	25732	25737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003267	TCTT	2	8	25840	25847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_003267	TAT	2	6	25855	25860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003267	TC	3	6	25862	25867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_003267	CT	3	6	25870	25875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_003267	CAA	2	6	25905	25910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_003267	T	6	6	25985	25990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003267	T	6	6	26040	26045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003267	CTC	2	6	26167	26172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_003267	TTAG	2	8	26925	26932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003267	TTG	2	6	26941	26946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003267	AG	3	6	27499	27504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003267	GAA	2	6	27541	27546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003267	ATTT	2	8	28230	28237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003267	TTC	2	6	28244	28249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_003267	T	6	6	28264	28269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003267	CAA	2	6	28282	28287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_003267	TCA	2	6	28338	28343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_003267	ATG	2	6	28389	28394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003267	TA	4	8	28676	28683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003267	AT	5	10	28739	28748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003267	ATA	2	6	28752	28757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003267	GAACC	2	10	28805	28814	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_003267	TACA	2	8	28856	28863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_003267	CGA	2	6	28882	28887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_003267	TAA	2	6	29710	29715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003267	ATT	2	6	29768	29773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003267	ATTA	2	8	29796	29803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003267	T	7	7	29819	29825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003267	TGTT	2	8	29831	29838	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003267	T	7	7	29866	29872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003267	CGAAG	2	10	29942	29951	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_003267	ACCA	2	8	30001	30008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_003267	ATCCA	2	10	30010	30019	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_003267	TAAAT	2	10	30030	30039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003267	AAT	2	6	30167	30172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003267	TG	3	6	30175	30180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003267	TGA	2	6	32571	32576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003267	A	7	7	32805	32811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003267	A	6	6	32833	32838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003267	A	6	6	32849	32854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003267	ATTT	2	8	32869	32876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003267	AAT	2	6	38046	38051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003267	GTC	2	6	38122	38127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_003267	GAATT	2	10	38136	38145	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003267	CTA	2	6	38221	38226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_003267	TTC	2	6	38260	38265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_003267	AAT	2	6	39624	39629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003267	TTC	2	6	43035	43040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_003267	TC	3	6	46095	46100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_003267	CTA	2	6	47261	47266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_003267	TCT	2	6	47269	47274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_003267	CTT	2	6	47640	47645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_003267	ACC	2	6	75237	75242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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293	NC_003267	ATCA	2	8	77159	77166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
294	NC_003267	GTA	2	6	77958	77963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_003267	TGT	2	6	78433	78438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_003267	GTT	2	6	78461	78466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_003267	CCCT	2	8	78521	78528	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
298	NC_003267	T	6	6	82279	82284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_003267	ATT	2	6	82313	82318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_003267	ATA	4	12	82329	82340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_003267	TAT	2	6	82355	82360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_003267	ATG	2	6	82453	82458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_003267	T	6	6	82474	82479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_003267	ATTA	2	8	82495	82502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_003267	CATTCC	2	12	82593	82604	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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312	NC_003267	TTA	2	6	83628	83633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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317	NC_003267	GTA	2	6	83884	83889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
318	NC_003267	ATT	2	6	83896	83901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_003267	GTA	2	6	83905	83910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_003267	AGCA	2	8	84087	84094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
324	NC_003267	CA	3	6	84096	84101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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326	NC_003267	CTT	2	6	85204	85209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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332	NC_003267	CAG	2	6	85416	85421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
333	NC_003267	ATT	2	6	85451	85456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_003267	CTG	2	6	85471	85476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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337	NC_003267	A	6	6	90255	90260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
338	NC_003267	TC	3	6	90288	90293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
339	NC_003267	TGC	2	6	92745	92750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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342	NC_003267	ATG	2	6	92873	92878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.